引起患者睾丸隐隐作痛的原因包括生理性原因和病理性原因，考虑具体情况如下：
1、生理性原因：多数是因为坐的时间过长或者坐姿不正确，导致睾丸受到压迫，形成隐隐作痛。
2、病理性原因：主要包括睾丸炎症、睾丸外伤、精索静脉曲张的情况，睾丸在细菌或者病毒的感染下，会导致睾丸出现疼痛感觉，伴有局部阴囊皮肤红肿。有睾丸外伤的情况会导致睾丸肿胀，并伴有隐隐作痛。也可能存在有精索静脉曲张的情况，因为睾丸内产生的废物不能经过扩张的精索静脉排出体外，废物在睾丸内储存时间过久，会引起睾丸隐隐作痛。可以通过彩超检查、血液常规检查，确定具体病因后给予对症治疗。