大便臭、口臭的原因可能是因为高蛋白、高营养食物摄入过多，导致人体无法完全吸收，产生大量吲哚，在体内代谢过程导致大便闻起来气味臭。另外，引起口臭和粪臭的原因还有食用高气体产生的食物，如土豆、洋葱、大蒜、芜菁和肉制品。这些食物在胃肠道消化时会产生大量气体，气体可以通过排便和打嗝排出。
肠道菌群紊乱，由于正常肠道菌群失调，病原菌成为优势菌群，在肠道发生作用，产生大量的气体，从而使口腔、大便有臭味。还可能是由胃部感染幽门螺杆菌引起，这些细菌在消化食物时会产生大量有臭味的气体，导致排便有臭味。所以，大便臭、口臭的原因有很多。