卵巢囊肿和卵巢癌都是原发于卵巢的肿瘤，卵巢囊肿是良性肿瘤，卵巢癌是恶性肿瘤。卵巢囊肿表现为在卵巢部位的囊性肿瘤，一般囊肿壁是比较薄的、光滑的，囊内容物透声是好的，而且囊内容物没有实性成分，囊肿的囊壁也没有血流信号，所以卵巢囊肿属于良性的卵巢肿瘤。
卵巢癌可以表现为卵巢的囊性、囊实性或者实性肿瘤，它的特点就是囊肿的囊壁比较厚，而且血流信号比较丰富，同时肿瘤标志物又有明显异常的升高。如果是囊实性的或者实性的肿瘤，实性部分回声又是不均匀的，而且血流信号会比较丰富，血流阻力比较低，这就是卵巢囊肿和卵巢癌的区别。