真菌性阴道炎治疗的方法不外乎两种，一个是口服药物，另一个就是外阴局部用药，局部用药包括两种，一个是清洗剂，另一个是阴道的栓剂或者是阴道凝胶，进行抗真菌治疗。
对于初发的患者，初次发病也就是第一次患真菌性阴道炎，或者患病次数比较少的1-2年一次，这种人对一些普通的抗真菌药物是比较敏感的，比如克霉唑阴道栓剂或者是制霉菌素栓或者中成药保妇康栓等，这些药物对于初发的患者效果比较好，一个疗程就足够了，同时配合洗剂，比如常用的复方黄柏液、妇康洗剂，局部用药就可以了。
对于某一些复发性的患者或者同时合并有糖尿病、免疫功能低下的患者，就要进行局部和全身用药配合治疗，同时要治疗原发病，治疗好原发病才好控制真菌性阴道炎，这种人常用可能会用口服的药物，比如氟康唑或者伊曲康唑口服，必要的时候加上阴道局部用药配合治疗。