手足口病是由多种人肠道病毒引起的常见传染病，人是人肠道病毒的唯一宿主，患者和隐性感染者均为本病的传染源。阴性感染者难以鉴别和发现，发病前数天感染者咽部与粪便都可以检测到病毒。通常发病后一周内传染性最强，传播的途径主要是肠道病毒可以通过胃肠道也就是粪-口传播，也可以通过呼吸道飞沫、咳嗽、打喷嚏等传播。
还可以通过接触患者的口鼻分泌物、皮肤或者黏膜、疱液，以及被污染的手和物品等造成传播，目前还不明确是否可以经过水或者食物传播。手足口病的传播途径，包括粪-口传播、呼吸道空气传播、密切接触方式传播，传染性强，传播途径也比较复杂。人对肠道病毒普遍易感，不同年龄组均可感染发病，以5岁及以下儿童为主，尤其是3岁及以下儿童的发病率最高。