过敏性结膜炎眼药水种类很多，一般是使用肥大细胞稳定剂，如色甘酸钠眼药水治疗，使肥大细胞不释放炎症介质。有的是组织胺受体阻断剂，如氮卓斯汀眼药水，与细胞组织胺受体结合，阻止炎症介质组织胺释放。毛细血管收缩剂，如肾上腺素眼药水，收缩血管使组织充血、发红现象消失。
糖皮质激素类眼药水，如泼尼松龙滴眼液，抗炎、抗过敏效果好。非甾体抗炎药物，如普拉洛芬眼药水，有抗组织炎症作用。过敏性结膜炎用什么眼药水治疗好使，需要根据过敏性结膜炎类型、过敏原性质等决定。枯草热性过敏性结膜炎，避开可能的过敏原就可以恢复正常，一般不需要药物治疗。春季卡他性结膜炎预防复发，需要在复发前使用色甘酸钠眼药水治疗，发作时短期使用糖皮质激素滴眼液进行治疗。