目前国内医疗界对肛周脓肿的手术选择主要有两种方式：一种是行切开引流术，待形成肛瘘以后做二次肛瘘手术；另一种是直接行肛周脓肿切开挂线术。两种手术均可以在骶管麻醉或者硬膜外麻醉下进行，如果脓肿位置表浅，范围很小，也可以在局麻下进行操作。
两种手术方式各有优缺点，前一种手术方式痛苦比较小，二次肛瘘时候内口的寻找比较容易，手术相对比较简单，缺点是增加了患者住院的费用需要两次住院手术。
后一种手术方式操作起来比较复杂，寻找内口比较难，因此如果技术不够可能会导致手术失败，优点是一次手术完成，不需二次手术。
因此，患者要看具体的情况进行选择，来进行哪一种手术来治疗肛周脓肿。