小儿偏头痛的治疗目前主要是以药物治疗为主，目前应用于临床的主要药物有以下几种：
一、非甾体类抗炎药物，比如布洛芬、对乙酰氨基酚，以及5-羟色胺受体的激动剂，比如说曲坦类药物。
二、预防性治疗的药物，目前比较常用的有β受体阻滞剂，比如说普萘洛尔。
三、5-羟色胺受体拮抗剂，比如说苯噻啶。
四、钙离子通道的阻滞剂，尼莫地平、氟桂利嗪。
五、三环类的抗抑郁药物，比如阿咪替唑。
还有一些非药物性的治疗，比如生物反馈疗法，是一种自我调节的方法，适用于长期应用药物效果不明显的患者。此外，还可以进行生活压力的自我调节，从心理上放松，同时养成良好的睡眠习惯。饮食方面要注意尽量不吃含有兴奋和加重偏头痛发作的食物，比如说油炸食品、酒类、巧克力等。