牙髓炎的晚期说明整个牙髓都出现了炎症，治疗需要进行根管治疗。应该彻底清除根管内的感染，因为根管系统解剖比较复杂，所以需要检查根管的数目和根管的形态，主要是通过临床检查和X线片检查进行确认。
然后多种方法综合使用，以达到尽可能彻底的清创效果。可以通过机械预备、化学预备和根管消毒，去除根管内的腐败、坏死组织和根管系统内的细菌及感染物质。
通过根管消毒，就可以彻底的冲洗根管，使根管达到清洁。然后进行根管换药，经过反复的根管换药，使根管内的细菌完全被清除。再进行根管预备和根管充填，就可以达到治疗牙髓炎的目的。