如果大便有不消化的奶瓣、酸臭味，考虑是饮食不当引起的消化不良导致的拉肚子，要口服助消化的药物，如鸡内金散等。如果大便呈蛋花汤样水样便，考虑是病毒感染引起的拉肚子，要口服蒙脱石散、益生菌，同时多喝水防止脱水。
如果大便含黏液甚至有脓血，要考虑是细菌性肠炎引起的拉肚子，要在医生的指导下应用抗生素治疗。如果是因为奶粉过敏引起的拉肚子，需要吃氨基酸奶粉、水解蛋白奶粉，乳糖不耐受引起的拉肚子需要吃无乳糖奶粉。