小孩心肌炎病情轻重不一，根据起病的年龄、感染的急性和慢性过程，孩子的症状有所不同。大部分患儿起病的前期有病毒性感染史，起病隐匿，多表现出乏力、活动受限、心悸、胸痛等症状。极少数重症的患病儿童可发生心力衰竭，并发严重的心律失常、心源性休克，甚至猝死。
有一少部分儿童心肌炎呈慢性进程，逐渐演变成扩张型心肌病。在新生儿时期出现心肌炎，病情常进展迅速，常表现出发热、反应低下、呼吸困难和发绀，可伴有神经系统、肝脏和肺脏的并发症。