抗乙肝病毒的药物，首先有长效的干扰素，长效干扰素可对乙肝病毒有一定杀灭作用，但需要应用的时间比较长，禁忌症比较多，从临床上很难单独通过干扰素的治疗，达到完全治愈的状态。在临床上比较常用的是口服核苷类似物，目前在临床上比较常用的有两种，分别是替诺福韦和恩替卡韦。相应的区别，恩替卡韦不能够在妊娠的患者中应用，而替诺福韦可以；替诺福韦有较小可能出现肾损害，而恩替卡韦不会；恩替卡韦在服用的时候，需要与吃饭割比较长的时间，因为吃饭会影响恩替卡韦的吸收，从而有可能影响它的效果。其他的抗病毒药物，还有丙酚替诺福韦，像之前应用的拉米夫定、替比夫定及阿德福韦酯，目前在临床上应用的相对较少，因为它们出现耐药的可能性比较高。