大叶性肺炎是由肺炎链球菌引起的，咳铁锈色痰与肺炎链球菌引起肺的病理改变是有关系的。大叶性肺炎的病理改变包括肺脏的充血期、红色肝变期、灰色肝变期及消散期。
表现为肺组织充血、水肿，肺泡内浆液渗出及红白细胞浸润，白细胞吞噬细菌，继而纤维蛋白渗出物溶解，吸收肺泡重新充气，肝变期病理阶段实际并无明确分解，经早期应用抗生素治疗，典型病理的分期已经很少见。铁锈色痰是由于红细胞渗入到肺泡，红细胞中的血红蛋白分解，含铁血红素混入痰液，使痰呈铁锈色。