甘草锌颗粒上市后的不良反应报告显示，按照说明书推荐的剂量和疗程合理使用比较安全，患者普遍耐受性良好，不良反应较少。偶见患者出现恶心、食欲不振、腹泻、腹痛等胃肠道反应。一般症状较为轻微，停药后症状就可以消失。
出现胃肠道不良反应的患者可以饭后服药，以降低胃肠道不良反应的发生率。还有极少数患者服药后会出现皮疹、瘙痒等不良反应，对此药过敏者禁用。大剂量、长期使用，个别患者可能会出现排钾潴钠和轻度的浮肿，停药后症状一般会自行消失，如果情况严重请去医院就诊。此药属于非处方药，如服用过量或出现严重的不良反应，应立即就医。