治疗霉菌性阴道炎的首选药物有一些，例如克霉唑，也就是所说的卡尼丁，还有就是制霉菌素阴道栓。治疗霉菌性阴道炎主要是在阴道局部上药，对于无法阴道上药的女性可以采取口服药，可以口服氟康唑，也就是所说的大扶康。
在治疗的过程中，女性朋友应该注意个人的卫生，不要穿紧身裤，不要为霉菌的滋生提供条件。如果有一些基础疾病，也应该积极治疗，例如糖尿病，糖尿病的女性容易患有霉菌性阴道炎，而且容易反复复发，所以要积极治疗糖尿病。如果是因为应用了抗生素，导致的霉菌性阴道炎，这时候要先停用抗生素。