小的肾结石如结石小于0.6cm，通常采用药物保守治疗，约80%左右的病人可以自行排除。当结石大于0.6cm，小于1cm时，首选体外冲击波碎石治疗。如果病人结石排出困难，体外冲击波碎石治疗失败时，可以考虑做输尿管镜碎石治疗。
如果结石较大大于1cm，小于2cm时，可以采用输尿管软镜碎石治疗。如果结石大于2cm，建议采用经皮肾镜碎石术，可以把结石大部分取尽排出。