膝关节行关节镜手术可能会有一些并发症，比如血管损伤、关节感染、关节软骨损伤、关节腔内出血、器械断裂、穿刺口周围的水肿。关节腔出血通常比较少见，如果损伤了关节囊后壁的大血管，可能会引起大量的出血，膝关节感染发生的概率虽然比较少，但是也有。
还有就是血管的损伤，在比较复杂的膝关节镜手术，比如行后交叉韧带重建术，需要处理关节后腔的时候，有可能会损伤后侧的大血管引起肢体缺血，甚至导致截肢的后果。还有就是关节镜操作过程中操作不当，引起关节软骨的损伤。