小儿心肌炎的早期症状，在心肌炎发病前数天或者是两周之内，孩子会有呼吸道或者是消化道的感染，可以伴有中度的发热、咽部的疼痛、腹泻、皮疹等症状，随后逐渐出现心脏的症状。轻症的心肌炎孩子可以没有自觉症状，或者仅有一过性的心电图表现，也有可能出现精神不振、乏力、食欲欠佳等非特异性的症状。
重型的心肌炎可以表现为小的婴儿出现拒食、面色苍白、呕吐、阵发性的烦躁、软弱无力、四肢末梢凉、呼吸困难、干咳。年长的孩子可以描述有心前区的疼痛、头晕、头痛、心悸，可以有急性的腹痛、肌肉疼痛、烦躁不安、面色发绀等症状。