病毒性咽峡炎最典型的疾病就是疱疹性咽峡炎，它是由柯萨奇病毒等肠道病毒引起的呼吸道传染性疾病。病人会有发热、咽痛、咽峡部疱疹，有少数病人还会有咳嗽、呕吐等症状。
通常这个病会发生在六岁以下儿童，成年人也有散发。治疗上首先对这类病人要进行隔离，避免交叉感染。
如果有高烧，超过38.5℃，要给予物理降温，同时给予药物的降温，局部可以用干扰素进行雾化。通常这个病在一周左右痊愈，只有少数患儿可能会有严重并发症，比如脑炎、心肌炎等。