颅底脊索瘤晚期的症状如下：
1、会出现非常难以忍受的疼痛，而且剧烈频繁发作，一般的止疼药物无法完全将其纠正，往往都需要通过特殊的毒麻类药物才能缓解。
2、占位效应不断扩大，包括压迫垂体、下丘脑、脑干等各种器官，因此可能会造成内分泌功能紊乱，形成水和电解质功能异常、多尿、昏迷等情况，病情会急转直下，在部分时候脊索瘤更加严重，可能会侵蚀骨质，造成脑脊液鼻漏等异常情况，从而导致逆行性颅内感染，造成患者死亡。
所以，颅底脊索瘤晚期是不断消耗的过程，症状可能会突然加重。