在临床上扁桃体发炎分为急性扁桃体炎和慢性扁桃体炎，通常急性扁桃体炎可以口服药物治疗或者静脉输液药物治疗，比较有效，最有效的药物有头孢氨苄片、阿莫西林胶囊、青霉素V钾片、头孢克肟、罗红霉素等。
在扁桃体发炎时，口服以上的药物，任选其一，口服一周，即可治愈急性的扁桃体炎。如果是患者患有慢性的扁桃体炎，通常与患者病灶性扁桃体有关，扁桃体隐窝内有细菌潴留，细菌长时间在体内发作、繁殖，继而引起扁桃体炎反复发作，此时最有效的办法是在全麻下行扁桃体的摘除手术，术后患者的扁桃体发炎症状即可完全的消失。
在治疗期间，患者需要多喝水，多吃水果、蔬菜，避免辛辣刺激性饮食，同时适当体育锻炼，增强体质。