上颌窦囊肿的手术费用，因手术方式不同而不同，一般情况下有两种方式：
一、上颌窦根治术，从齿龈沟进口，同时凿开上颌窦前壁摘除上颌囊肿，这种手术手术创伤比较大，术中易出血，对患者损伤比较大，费用大约是8000元左右。
二、视内窥镜下上颌窦囊肿摘除术，这是一种比较先进的手术方式。手术比较创伤比较小，患者没有痛苦，费用大约是10000元左右。因为患者住院后，还需要行常规的相关检查，比如血常规、尿常规、凝血机制、生化检查、乙肝、梅毒、艾滋病。
同时，还需要请相关的科室会诊，比如呼吸内科、循环内科、麻醉科以及手术室，术后患者还需要使用抗生素，包括药费，术后需要使用3-5天，大约1周就可以出院。