阴茎延长术在临床上用于治疗阴茎短小症，具体的方法需要在半身麻醉下来进行手术，消毒、铺巾以后，在阴茎根部的皮肤做一个倒W形切口，仔细分离皮肤、皮下组织，注意不要碰伤神经和大血管，找到阴茎脚、阴茎悬韧带，将两侧的阴茎悬韧带切断，而后仔细的止血、缝合，将皮肤的倒W形切口缝合成Y形切口，这样就人为的延长了阴茎体表的长度。
阴茎延长术以后体表的阴茎长度会有所增加，但是由于两侧的阴茎悬韧带切断，所以勃起以后的稳定性可能不如原来。所以临床上认为成年男子阴茎在静息状态下小于4cm或者是勃起状态下小于7.5cm者，需要考虑行阴茎延长术，不主张作为常规手术来进行，也不主张应用于婴幼儿。