尿毒症是慢性肾脏病的终末期，在临床上很多疾病可以引起慢性肾脏病，最终发展为尿毒症，这些肾脏病包括慢性肾小球肾炎、肾小管间质性的疾病，以及肾血管性的疾病、代谢性的疾病、结缔组织疾病性肾损害。还有各种原因引起的感染性的肾损害，以及先天性、遗传性的肾脏疾病等多种疾病。
在我国以IgA肾病为主的原发性肾小球肾炎最为多见，然后是糖尿病肾病、高血压肾小动脉硬化、狼疮性肾炎、慢性肾盂肾炎，以及多囊肾。还有服用各种肾损伤的药物，所引起的慢性间质性的肾损害，也是造成尿毒症的主要因素之一。