抗生素并不是对所有的牙疼都有效，比如牙髓炎，抗生素就没有什么明显的效果。这个牙髓是位于牙齿中间，位于牙髓腔里头，牙髓腔周围都是硬组织，是封闭的空间，它仅仅是通过根尖孔有非常细小的，比头发丝还要细的小孔跟外界交通、交换营养。牙髓一但发炎，服用抗生素也是要通过根尖孔来进入牙髓的。这么细小的根尖孔，抗生素能进入牙髓腔的可能就非常非常少，所以服用抗生素绝大多数药物进不到牙髓里面，所以发挥不了作用。
还有其他的情况，比如说牙龈脓肿、牙周脓肿、智齿冠周炎，这种属于是软组织中的炎症，这样服用抗生素就是有效果的。