婴儿肛周脓肿自愈几率比较小，一旦发现肛周脓肿及时去医院就诊采取治疗，一般积极治疗需要3-6周。
婴儿肛周囊肿，多表现为肛周的肿胀、疼痛。切开引流是肛周囊肿的首要治疗方法。以免感染进一步扩散，通过手术进行彻底清理，加上抗感染药物配合，3-6周可以治愈，平时注意观察宝宝肛周脓液的情况。脓液多采用二段式手术的方法，先切开排脓，2个月后使脓腔治愈形成瘘道，再采取一次性切除造瘘的方法，手术后加强护理。
婴儿的肛周脓肿一般不建议过多的干预，因为创伤过大，只需要切开引流，引流通畅即可。如果宝宝抵抗力比较低，需要加强营养。