非淋菌性尿道炎常见的病原体包括沙眼衣原体、解脲脲原体，还有葡萄球菌、大肠杆菌，甚至是一些病毒和真菌都有可能导致非淋菌性尿道炎。非淋菌性尿道炎的治疗通常需要采取尿培养选取敏感的药物。临床常用的包括有四环素类的药物例如多西环素，还有大环内酯类的药物例如红霉素等，还有喹诺酮类的药物包括左氧氟沙星。一般用药的疗程要1-2周，通常在患者的症状消失之后，还要继续用药一周以上，再复查尿常规，没有异常的才可以认为是治愈了。在治疗期间夫妻双方都要同时接受检查，必要的时候是要同时用药治疗的，避免以后发生交叉感染难以治愈。