正常情况下有巧克力囊肿的患者，它会导致不排卵，出现排卵障碍，一般会导致不孕情况发生。如果巧囊能够怀孕，说明巧囊没有影响到怀孕，如果双侧巧囊怀孕几率肯定没有，如果是单侧巧囊另一侧正常怀孕了，一般是问题不大，怀孕早期一定到医院做好相关检查，巧囊主要影响不排卵，出现不孕。怀孕以后如果体内激素水平正常，一般对胚胎影响不大，孕早期一定做好血HCG和孕酮检测。如果激素水平正常，没有流血、腹痛，B超显示胚胎在宫腔内发育正常，一般问题不大，巧囊怀孕一般不会影响太大，巧囊主要影响是会导致不孕。