慢性咽炎和慢性扁桃体炎的区别，在于发生慢性炎症状况的主要部位不一样，具体如下：
1、慢性咽炎：主要是咽部的黏膜、黏膜下组织以及局部的淋巴组织，发生慢性炎症的疾病状况，常常会在咽后壁黏膜表面发生一定程度的淋巴滤泡增生的情况。
2、慢性扁桃体炎：是扁桃体的慢性炎症、肿大的情况，部分患者的扁桃体隐窝内还可能会蓄积脓栓样的分泌物。
两者在症状表现上会有一些相似的地方，都可能会出现反复发作的咽部疼痛感、干燥感、异物感等不适的症状感受，有的患者有可能慢性咽炎和慢性扁桃体炎同时存在。