龟头炎和尿道炎通常都是发生于男性泌尿生殖系统的炎症，但是两者的区别在于，龟头炎主要是发生于龟头皮肤的感染性疾病，通常好发于包皮过长或者包茎的男性，而尿道炎通常属于男性下尿路感染性的疾病。
两者都可以由细菌、支原体、衣原体、滴虫以及一些性传播疾病，如淋球菌所导致。龟头炎通常表现为龟头的红、肿、热、痛以及伴有分泌物、溃疡、糜烂等，而尿道炎通常以尿频、尿急、尿痛为主要临床表现的一类疾病，两者的治疗包括口服以及外用抗生素进行治疗。