肿瘤筛查十二项主要是包括肿瘤标志物和肿瘤的筛查影像学检查。临床中常用的肿瘤标志物，癌胚抗原，是广谱的肿瘤标志物，从肺癌、胃肠道肿瘤、妇科肿瘤都用到肿瘤标志物，而且指标都会比较高。另外比较特异的是甲胎蛋白，是肝癌筛查的指标。还有CA19-9，是胃肠道常用的肿瘤标志物，如果指标增高，可能有胃肠道肿瘤、肺癌。
另外还会用到CA125，是胃肠道肿瘤和妇科肿瘤常用的肿瘤标志物。还会用到CA72-4，是胃肠道肿瘤标志物，CA24-2是胃肠道肿瘤标志物。还有用到SCC，是鳞状上皮细胞抗原，是鳞状上皮鳞癌的普遍应用的肿瘤标志物。还会让病人去筛查脑、颈部、腹部、盆腔的磁共振，而胸部要查CT，最好查增强。