幽门螺杆菌阳性提示机体有幽门螺杆菌感染，这是慢性胃炎、胃溃疡、胃癌的常见致病原因。如果发现幽门螺杆菌阳性应积极进行抗幽门螺杆菌治疗。最常用的治疗方法为三联疗法，即阿莫西林+甲硝唑+奥美拉唑，对于青霉素过敏者则可用克拉霉素+甲硝唑+奥美拉唑，症状较严重者可以在三联疗法的基础上加用枸橼酸铋钾治疗。
一般抗幽门螺杆菌感染的疗程为2-4周，停药1-2周后需重新进行幽门螺杆菌检测，如果幽门螺杆菌转阴性，临床症状缓解说明治疗有效，如果幽门螺杆菌仍为阳性可考虑更换抗菌药物，如四环素或左氧氟沙星联合奥美拉唑治疗。