甲状腺结节的发病原因临床上并不是很明确，和遗传、放射等有相关的联系。如果直系亲属中有甲状腺疾病的患者，遗传性酶出现缺陷，会导致激素合成障碍，会隐性遗传于后代。碘存在于盐、海类产品里面，碘对甲状腺激素的分泌有直接的影响，如果碘的摄入量比较低，容易导致甲状腺水平异常，增加患甲状腺结节的风险。
如果是本身有甲亢的患者，会因为碘摄入过多而加重病情。建议甲状腺疾病的患者不要根据自己的判断控制碘，幼儿时期经历过放射的孩子患甲状腺结节的概率也会增加。