青少年精神分裂症的治疗方法主要有药物治疗、物理治疗，以及康复心理治疗。药物治疗目前使用新型的抗精神病药为主，主要有阿立哌唑、利培酮、喹硫平、齐拉西酮、氨磺必利，在治疗过程中大多选用第二代这种新型的抗精神病药，这类药副反应比较小，较少出现明显的锥体外反应，以及闭经、体重增加、坐立不安这些现象。
在治疗过程中如果精神病症状比较明显，像幻觉、妄想、行为紊乱等症状，药物治疗效果比较差，常常可以使用电抽搐治疗，能够尽快改善精神病性的症状，症状改善以后继续使用抗精神病药维持治疗。针对青少年精神分裂症，由于发病比较早，应该早期尽快把症状控制，减少精神病症状的残留，部分精神分裂症还容易反复发作。在治疗过程中需要定期检测抗精神病药对肝肾功能，以及心脏方面的影响，可以做康复心理治疗训练等。