宫腔镜下人工流产手术对人体的伤害和普通的人工流产的伤害一样，人工流产对子宫内膜的损伤大多数可逆，但是反复多次的人工流产，可能会对子宫内膜造成伤害，而且恢复比较慢，甚至会造成宫腔粘连的发生。
宫腔镜下的人工流产和普通人流的区别，主要在于宫腔镜指示下判断宫腔孕囊的位置，以及人流术后宫腔是否有残留，另外还可以判断宫腔的形态，对于胚胎停止发育需要行人工流产的手术时，宫腔镜可以判断是否因为宫腔内的病变，比如子宫不全、纵隔等因素。所以宫腔镜下的人流和普通人流区别只是在于同时行宫腔镜检查，以利于明确宫腔内的病变，并且对于术后宫腔残留有很好的预防作用。