先天性的风湿病一般是不能治愈的疾病，往往是由于患儿在胚胎内就形成一定的病变，通常也跟先天性的生长发育异常有直接关系。但大多数的患儿经有效治疗后，也可以控制住病情、改善预后，主要是针对具体的病变而采取对症处理的原则。
首先当出现关节、肌肉病变的时候，或者出现明显的关节肿胀、疼痛、炎症性的表现。其可以应用非甾体抗炎药，比如扶他林、美洛昔康、塞来昔布等，或者联合小剂量的糖皮质激素来治疗。
其次出现皮肤、黏膜损害的时候，可以使用抗疟药，如羟氯喹或者联合沙利度胺以及小剂量激素治疗。另外有内脏受累的时候则需要应用免疫抑制剂，比如环磷酰胺、硫唑嘌呤、甲氨蝶呤等来联合治疗。