卵巢囊肿手术后，多数不会复发。在手术当中会将囊肿切除后送病理化验，如果只是炎性的包块，在手术后注意给予足够的抗感染的药物进行治疗，以后若没有炎症的发生，就不会导致复发，少数情况下是会导致复发。如果是女性患的是卵巢巧克力囊肿，手术后是会复发。巧克力囊肿是子宫内膜异位中的一种，术后女性有正常的月经来临，此处就会有异位的内膜生长，因此就会导致复发。如果是女性患有卵巢的恶性肿瘤，例如未成熟畸胎瘤、绒毛膜癌等，在手术后也会导致复发。因此女性在做卵巢囊肿手术后，一定要注意定期复查，避免复发，并定期做B超检查。