孩子在咳嗽时候能不能打疫苗，要具体看情况而定。要注意确认孩子咳嗽的程度，以及引起咳嗽的原因。有些孩子可能会有偶尔的咳嗽，尤其在小月龄孩子中比较常见，可能和孩子的唾液吞咽不协调，或者周围的刺激因素等等引起的，这种情况下咳嗽非常偶尔，也没有其它的异常表现，是可以正常接种疫苗的。
除此之外，还有一些孩子的咳嗽是因为呼吸道感染所引起的，孩子会有比较明显的呼吸道感染表现，比如鼻塞、流涕、咳嗽、咳痰，甚至会有发热等等。当孩子有呼吸道感染的时候是不能接种疫苗的，疫苗的接种需要推迟，等孩子的呼吸道感染彻底恢复之后再考虑接种。
还有一部分孩子是因为过敏所引起的咳嗽，过敏性咳嗽要具体看情况，一般情况下不影响孩子接种疫苗，除非孩子的过敏表现非常严重，或者有特殊类型的过敏，比如孩子有非常严重的蛋类的过敏，这时候某些疫苗可能就不能接种。同时孩子接种疫苗之后要注意在医疗机构做观察，看看孩子有没有异常的表现。所以有咳嗽的孩子能不能打疫苗，要根据孩子引起咳嗽的诱因，以及其情况等来具体情况具体分析，再确认能不能打疫苗。