阴道萎缩大部分是由于雌激素水平低下所导致，也就是更年期以后，由于卵巢功能下降，卵巢内卵泡耗竭，导致体内雌激素分泌过低，而引起阴道黏膜的萎缩。治疗方法以补充雌激素为主，其中补充雌激素有三种途径，包括口服的途径、经阴道的途径、经皮局部涂抹。这三种给药方式需要根据患者的需求，以及是否有用药禁忌症进行选择。
口服雌激素是通过胃肠道吸收，有肝首过效应，用药前需要排除用药的禁忌症。另外，在补充雌激素的同时，有子宫的患者需要加用孕激素进行拮抗，由于雌激素会导致子宫内膜增殖，要避免由于雌激素的补充，导致子宫内膜发生病变。而阴道填塞的雌激素软膏以及经皮的雌激素软膏，主要对于阴道的局部治疗效果比较明显，而且没有肝首过效应，治疗方法比较简单，容易被患者接受。