CT诊断食管炎效果不理想，CT可以发现食管比较大的占位性病变，但对食管黏膜不能进行直视，很难判断黏膜损伤的程度。食管炎的诊断主要靠钡剂检查和内镜检查，食管吞钡检查能够发现部分食管病变，如食管溃疡或狭窄，但也有可能会遗漏浅表性溃疡或糜烂。气钡双重造影对反流性食管炎的诊断特异性很高，但敏感性差。
临床上常用内镜检查，内镜可以对食管黏膜进行直视检查，这是判断酸产生的食管黏膜损伤及其并发症的有效方法，并可以评估疗效和预后。除上述两种检查，食管炎的诊断还需要进行食管24小时pH值监测以及pH-阻抗监测、食管胆汁动态监测以及食管测压，来综合评估食管炎的病情，以制定更好的方案，给予及时的治疗。