男性不育症的检查包括了精液检查，可以了解睾丸的生精功能、精子数量和质量等多种参数，还有附属性腺的分泌功能。附属性腺分泌功能的生化标志检查主要是通过精液的生化检查来完成，附属性腺普通的生化物代表不同功能，如枸橼酸锌等可以评估腔隙性的功能，果糖和前列腺素是精囊功能的标志，内分泌检查的生殖激素主要包括了血浆睾酮、卵泡刺激素、黄体生成素、雌二醇、催乳素，检查主要包括雌激素以及克罗米芬刺激试验、促性腺激素释放激素兴奋试验以及人绒毛膜促性腺激素的刺激试验，免疫学的检查主要是检查血清和精液中的抗精子抗体，但是这些抗体有可能与不育有关，也有可能不会引起不育。
染色体检查主要做性染色体核核型鉴定，往往是用于每次射出精液精子总数少于20000000，睾丸容积只有10mL，甚至更少的时候，睾丸活检是进行生殖的病理检查，能够直接判断精子发生的功能和精子发生障碍的程度，同时对睾丸合成类固醇激素的能力及其障碍进行定量评分，X线检查主要是做阴道造影，对确定射精和生育的影响很有价值，可分为三部分，即附睾和输精管、输精管和精囊以及尿道的附属物，精子的功能学检查包括了精子活力、膜完整性、精子形态、精子结合到透明带、顶体形态及顶体反应、精卵相互作用的评估、精子结合到卵膜、精子染色质扩散试验，其它检查还包括内镜检查、同位素检查、超声诊断检查以及阴囊热像仪检查。
