复方黄连素片没有明确的服药时间规定，说明服药时间对药效影响不大，饭前吃或者饭后吃都可以。从最佳服药时间的角度考虑，需要具体问题具体分析。饭前服药的优点是可以减少食物对药物吸收的影响，提高药物的生物利用度，因此饭前吃复方黄连素可以让药物更好发挥作用。
对于少数服药后出现恶心、呕吐等胃肠道反应的患者，饭后服用会更有利于病人的健康。平素脾胃功能较弱的患者，从保护胃肠道的角度考虑也可以饭后服药，因此可以根据实际情况选择适合自己的服药时间。此药属于处方药，必须在医生的指导下合理使用，对此药过敏者禁用。