尿道结石绝大部分是由膀胱掉入尿道所导致，尿道结石的临床症状通常包括疼痛、排尿困难、血尿、尿道分泌物、尿道硬结以及压痛。
疼痛是上尿路结石排入尿道过程中，由于突然的嵌顿造成局部剧烈的疼痛以及排尿痛，常可以放射至阴茎头部。结石阻塞尿道可出现不同程度的排尿困难，甚至严重的可以出现急性尿潴留。
急症的病例常有终末的血尿或初始的血尿，与结石对尿道的刺激损伤有关，前尿道结石可在结石部位扪及硬结并有压痛。其他的症状，可以导致尿道炎症、尿道狭窄、尿道周围脓肿及尿道皮肤瘘，甚至引起上尿路的继发性损害。