婴儿出现甲减时，复查的时间主要与病程相关。治疗的初期，需要密切的检查甲状腺功能才能调节药物的用量，所以一般每2周一次。调节药物用量后，维持血清的促甲状腺激素和甲状腺激素正常后，每三个月复查一次。
甲状腺功能恢复正常后，1-2年后应该每6个月复查一次。如果患儿出现明显的不适，或者症状明显加重时，需要及时的复查甲状腺功能，没有时间上的规律。期间应严格遵医嘱用药，不得擅自停药，以免影响治疗效果。