抗菌药物的适应症，一般包括以下几种：
第一、细菌感染：如果确定是细菌感染，通常可以选用抗菌药物治疗。具体选择的药物需要结合感染的部位，治疗的疗程也需要结合感染的人群，以及感染的部位来决定。应用抗菌药物的适应症，还包括结核杆菌的感染，如果确定为结核杆菌的感染，可以选择抗结核的抗菌药物来治疗，比如异烟肼、利福平、乙胺丁醇、吡嗪酰胺等。
第二、非典型病原感染：如果确定是支原体、衣原体或者军团菌等非典型病原的感染，也需要应用抗菌药物治疗。一般会选择大环内酯类药物，比如阿奇霉素、罗红霉素，或者选择四环素类的药物，比如多西环素、米诺环素等。另外，也可以选择氟喹诺酮类的药物，比如左氧氟沙星、环丙沙星等。
对于抗菌药物的治疗，通常需要确定是细菌感染，或者非典型病原感染，只有确定这些适应症之后，才能够选择抗菌药物治疗，否则可能会因过度应用抗菌药物而引起细菌耐药的问题。