会厌囊肿目前都采用全麻下支撑喉镜激光手术或者用等离子烧灼会厌囊肿，一般术后会疼痛2-3天，术后第1天时疼痛会比较明显，但是随着伤口的愈合疼痛感会逐渐的减轻，大概在1周左右疼痛应该就会消失了。
但是有的人术区恢复得并不是很好，如果有感染的迹象，疼痛可能会持续的更久，严重时可能会半个月左右才能痊愈。
建议在做完手术之后需要应用抗生素积极的预防感染，临床上常用的是头孢呋辛钠注射液，出院之后还需要口服头孢呋辛酯片，配合蓝芩口服液巩固消炎治疗。