月经干净后出现肚子痛，需要考虑生殖系统疾病或胃肠道疾病以及泌尿系统疾病而导致。首先，生殖系统疾病最常见的是由于生殖系统炎症而导致的腹部疼痛，其中以子宫附件炎最为常见。大部分女性是由于盆腔积液而导致的下腹部的疼痛，还会出现阴道分泌物的增多、附件区或子宫部位有压痛，进行超声检查可以明确诊断。其次，比较常见的是生殖系统的肿瘤，以囊肿以及肌瘤最为常见。胃肠道疾病主要是急性胃肠炎导致的腹部疼痛，大部分有恶心、呕吐、腹泻、腹胀等胃肠道不适症状。最后，泌尿系统疾病导致腹部疼痛以泌尿系统结石最为常见。