胃镜主要针对早期胃癌和食管癌的诊断，而钡餐能够十分清晰的展示出患者胃肠道内的形态、产生病变的范围，同时该方法也具有简单、有效、花费少的优点。研究结果显示，使用胃镜进行诊断的检出率显著高于钡餐，但在检查患者肠胃功能方面，钡餐的检查方法独一无二，且不可取代。
对于将要接受手术治疗的患者，钡餐检查能够从一定程度上确保手术的质量和效果。对于患者肠胃内部比较狭窄的区域，胃镜一般无法通过，因而不能对这些部位进行检查，但钡餐检查没有这种限制，所以两种方法相比之下，X线钡餐在检查患者肠胃内比较狭窄的区域更有优势，更能够帮助医生做出准确判断。