碘伏治疗龟头炎的效果很好，不论是细菌感染引起的龟头炎还是霉菌感染引起的龟头炎，都可以用碘伏治疗。但是碘伏有一定的刺激性，如果是对碘伏过敏的患者用了碘伏以后，可能加重龟头炎的情况，所以一般在选择用碘伏治疗龟头炎之前需要把碘伏溶液稀释，通常是配成0.5%的碘伏溶液比较安全、可靠。
除了碘伏以外，目前治疗龟头炎还需要根据致病微生物的种类选择药膏治疗，一般细菌感染引起的龟头炎可以涂抹红霉素软膏、夫西地酸软膏对症治疗效果会比较好。如果是由于霉菌感染引起的龟头炎，最好是能够涂抹克霉唑软膏、酮康唑软膏对症治疗效果会比较好。