一般生殖细胞肿瘤的症状，与生殖细胞肿瘤发生的部位有明显的关系，在男性和女性患者方面也有明显的不同，比如女性的生殖细胞肿瘤，常常发生在卵巢，病人可以用下腹部不适或者盆腔下坠的感觉，可以同时伴有进食的减少、恶心、胃部不适等胃肠道症状。如果卵巢的肿瘤比较大，或者有腹水出现，可以有腹胀的感觉，有些病人可以在腹部摸到包块。
此外卵巢生殖细胞瘤的病人，还可以出现月经的紊乱和内分泌失调的表现。男性的生殖细胞肿瘤主要是发生在睾丸，可以表现为睾丸的进行性增大，可以摸到无痛性的肿块，有的病人伴有睾丸沉重下坠的感觉。当病人出现跳跃、跑步和站立过久的时候，上述症状可以加重。